Quelle interprétation des valeurs de Ct de la PCR Covid-19 ? 

Derrière les résultats de RT-PCR de dépistage du Sars-CoV-2 communiqués aux patients (positifs, faiblement positifs, négatifs, inexploitables), se trouvent les valeurs quantitatives de Ct. Ces valeurs traduisent le nombre de cycles de RT-PCR nécessaires à la détection de l'ARN cible, et sont donc en théorie inversement corrélées à la charge virale dans l'échantillon. Mais elles sont très variables et « ne signifient pas grand-chose à l'échelle individuelle », explique Samuel Alizon, directeur de recherche au CNRS, laboratoire Migevec, lors d'un webinaire de la SFM (Société française de microbiologie) du jeudi 27 mai 2021. De fait, ces valeurs dépendent de nombreux facteurs tels que le type et la qualité du prélèvement, la technique d'extraction de l'ARN (kit et/ou machine utilisée), les protocoles et réactifs de rétrotranscription, les réactifs et le protocole de PCR, la région génomique visée, etc. « La loi des grands nombres...