Augmentation de la résistance aux antibiotiques chez les souches de S. sonnei en France

Cette étude du Centre national de référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella (CNR-ESS) à l’Institut Pasteur se base sur l’analyse de plus de 7 000 souches de S. sonnei et d’informations épidémiologiques recueillies dans le cadre de la surveillance nationale des shigelloses par le CNR-ESS entre 2005 et 2021. Des souches dites hautement résistantes aux antibiotiques (et en particulier à quasiment tous les antibiotiques recommandés pour le traitement de la shigellose) ont été identifiées pour la première fois en 2015 et leur proportion a augmenté de façon importante jusqu’à atteindre 22,3% de toutes les souches de S. sonnei en 2021. La grande majorité de ces souches a été observée chez des hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes (HSH). L’analyse par séquençage génomique révèle que ces souches hautement résistantes appartiennent à une même lignée évolutive, originaire d’Asie du Sud. « Ce constat devrait être pris en compte par les cliniciens et les laboratoires dans le cadre des consultations pour infections sexuellement transmissibles (IST), avec pratique d’un antibiogramme systématique en cas d’isolement d’une Shigelle pour une meilleure prise en charge des patients infectés par ces souches hautement résistantes » résume l’Institut Pasteur.