Un système d’alerte pour détecter les variants à haut risque

Ce système a pour vocation d’analyser les données de séquençage génétique disponibles pour identifier et surveiller en temps réel l’apparition et l’évolution de variants à haut risque du SARS-CoV-2. Cette nouvelle méthode quantitative a été développée par la société d’immunothérapie BioNTech en collaboration avec InstaDeep, entreprise spécialisée dans l’intelligence artificielle. Elle « combine la modélisation structurelle de la protéine virale Spike et des algorithmes d'intelligence artificielle pour signaler en moins de 24h les variants potentiels à haut risque, sur la base de paramètres évaluant leur potentiel infectieux (par exemple l'interaction entre la protéine ACE2 et le variant de la protéine Spike) ainsi que leur risque d’évasion immunitaire » indiquent les créateurs. Le Early Warning System (EWS) a fait l’objet d’une publication disponible sur le serveur BioRxiv (envoyée pour publication dans une revue à comité de lecture). "Le repérage précoce des variants à haut risque potentiel pourrait être un outil efficace pour alerter les chercheurs, les laboratoires développant les vaccins, les autorités sanitaires et les décideurs, et de leur donner plus de temps pour formuler une réponse aux nouveaux variants préoccupants " déclare Ugur Sahin, M.D., Directeur Général et co-Fondateur de BioNTech. "Ce sont plus de 10 000 nouvelles séquences de variants qui sont découvertes chaque semaine et la communauté scientifique ne peut tout simplement plus faire face à autant de données complexes à traiter. InstaDeep a relevé ce défi en déployant les puissantes capacités de calcul de sa plateforme d’intelligence artificielle DeepChain, combinées au savoir-faire et à la technologie de BioNTech en matière de SARSCoV- 2. (…)  Nous sommes heureux de mettre nos travaux à la disposition de la communauté scientifique et, surtout, nous nous réjouissons de leur impact concret dans le monde", précise Karim Beguir, co- Fondateur et PDG d'InstaDeep.